Em 1986 ficou estabelecido o plano editorial do CEHA, com uma incidência temática obrigatória sobre a História das Ilhas Atlânticas e, em especial, a Madeira.
- COLECÇÃO MEMORIAS.O objectivo no momento era publicar estudos monográficos sobre a História das ilhas, com especial incidência para a Madeira. A maioria dos volumes publicados resulta de teses de mestrado e doutoramento apresentadas nas Universidades portuguesas.
- COLECÇÃO ATLÂNTICA.Coleção dedicada à publicação de estudos de divulgação relacionados com a temática histórica das ilhas atlânticas
- COLECÇÃO DOCUMENTOS. Coleção especializada na publicação de documentos e corpos documentais sobre a Madeira.
- COLECÇÃO História do Municipalismo. Coleção criada para publicação de estudos comparados sobre a História dos Municípios no Mundo Português.
- COLECÇÃO HISTÓRIA DA CIÊNCIA E DA TÉCNICA .Coleção criada para publicação de estudos sobre História das Ciências e das Técnicas.
- COLECÇÃO HISTORIA DA CANA DE AÇUCAR. Coleção criada em colaboração com a Associação Internacional de História e Cana de Açúcar, para divulgar os estudos e reuniões sobre o tema.
- SEPARATAS. Coleção dedicada à publicação de textos incluídos em revistas, actas de colóquios, ou obras colectivas.
Obs.: os números 4 a 65 correspondem às comunicações do II Colóquio Internacional de História da Madeira (1989), também editado em Livro.